Para habilitar la ejecución de aplicaciones de 32 bits en IIS 6.0 en la versión de 64 bits de Windows, es necesario acceder a tu Servidor mediante “Escritorio Remoto“.
Ya dentro del servidor, tendrás que abrir la consola de Windows (CMD) y acceder al directorio
%systemdrive%\Inetpub\AdminScripts
Dentro de este directorio tendrás que lanzar el siguiente comando, el cual habilitará la ejecución de aplicacions de 32 bits:
cscript.exe adsutil.vbs set W3SVC/AppPools/Enable32BitAppOnWin64 1